本片讲述了民国时期的一个传奇故事，日本人垂涎华夏大地的一种神奇花朵，于是胁迫御麟龙帮助他们寻找花朵，御麟龙为了保护花朵不被异族夺取而施展计策与他们斗智斗勇，并最终将侵略者消灭。最终，御麟龙等人终于将坂本击毙，成功将神奇宝贝保护在洞穴之内。